毛巾變硬主要是因為水中游離的鈣、鎂離子與肥皂結合，生成鈣鎂皂附著在毛巾的表面所致。為防止毛巾發硬，除了經常清洗之外，應當將毛巾放在堿水鍋里煮一刻鐘（一般1.5公斤水加30克純堿即可，注意要將毛巾全部浸入堿水中），煮后將毛巾取出并用清水徹底沖洗干凈。
毛巾表面油膩變黏，則是因為毛巾表面附著了大量的汗液、淚液、皮屑等分泌物。清潔表面滑膩的毛巾時，除了可以采用以上的方法以外，還可以將毛巾放在濃鹽水中煮或燙洗。
細菌最容易繁殖的自然條件是高溫高濕，因此毛巾要經常保持干燥。但是現在很多家庭的衛生間沒有窗戶，通風條件較差，所以要想保持毛巾的清潔，應該每天用肥皂清洗一次，然后掛在太陽下曬干或在通風處晾干。每周還應該將毛巾放在鹽水中煮一次。將毛巾用水浸濕后再用微波消毒也是一個很有效的殺菌方法。
毛巾之所以會成為“藏污納垢”之地，主要有3個原因。
其一，毛巾的主要成分棉纖維是管狀結構，含有中空的胞腔，可以儲存水分，濕度是細菌存活最重要的條件。
其二，毛巾常被放在濕熱的衛生間里，通風、透氣性較差，缺乏陽光直射，這樣的環境適合細菌生長。
其三，人體皮膚上的油脂、灰塵、皮屑、螨蟲、汗液等排泄物都會堆積在毛巾上，如果不定期清洗，就容易導致細菌成倍繁殖，引發交叉感染。
微波爐消毒，滅菌率98%以上
毛巾要一人一條分開用，不同部位不共用，至少3個月換一次。平時要有意識地清洗，有條件者可采用微波爐消毒，細菌消滅率達98%以上。將清洗后的毛巾放入微波爐專用保鮮盒，微波3~5分鐘即可。
高溫煮沸消毒不建議經常使用
將毛巾放在鍋里蒸煮，水開后5分鐘以上即可，煮毛巾時可以放入適量的堿以提高水的沸點，達到更好的消毒作用，但會影響毛巾的色牢度和強度，不建議經常使用。
選擇消毒劑消毒
將84消毒液用自來水稀釋100倍，然后將毛巾浸泡20分鐘，拿出來清洗干凈后晾干就可以了。最后還要進行暴曬：用洗滌劑清洗干凈后，將毛巾晾置在太陽下，暴曬2小時以上。
